Méthodes laboratoire pour détection virale

Techniques diagnostiques infections virales

1. Culture virale (Référence, lente) : Inoculation lignées cellulaires/cultures organes. Observation EPC (effet cytopathogène). 1–14 jours. Confirme viabilité.
2. Détection antigène (Rapide) : Test flux latéral (Ag-RDT), immunofluorescence (IFA), ELISA. Minutes–heures. Sensibilité inférieure à PCR.
3. Amplification acides nucléiques (NAAT/PCR) : RT-PCR, qPCR, RT-LAMP, CRISPR. Détecte ARN/ADN. Haute sensibilité/spécificité. Heures. Quantitatif (charge virale).
4. Sérologie (Anticorps) : IgM/IgG via ELISA, CLIA, neutralisation. Infection passée/réponse vaccin. Pas pour diagnostic aigu.
5. Microscopie électronique : Visualisation directe. Rare, spécialisé (identification épidémie, nouveaux virus).
6. Séquençage nouvelle génération (NGS) : Métagénomique. Non biaisé, découvre variants nouveaux/émergents. Jours, bioinformatique lourde.
7. Bioscapteurs / Point-of-Care : Microfluidique, électrochimique, papier. Émergents pour tests décentralisés.

Critères choix test

• Question clinique (aigu vs passé).
• Délai résultat nécessaire.
• Exigences sensibilité/spécificité.
• Infrastructure disponible.
• Coût.

PCR/NAAT est standard actuel pour virus respiratoires aigus (SARS-CoV-2, Grippe, VRS).