Pourquoi les horloges moléculaires ne sont-elles pas précises lors des comparaisons entre des organismes éloignés ?

Les horloges moléculaires reposent sur l’hypothèse que le taux d’évolution moléculaire est constant dans le temps. Cependant, cette hypothèse n’est pas toujours valable, surtout lorsqu’on fait des comparaisons entre des organismes éloignés. En effet, le taux d'évolution moléculaire peut être affecté par un certain nombre de facteurs, notamment des changements dans l'environnement, des changements dans les pressions de sélection agissant sur l'organisme et des changements dans la structure et la fonction des protéines étudiées.

En raison de ces facteurs, le taux d’évolution moléculaire peut varier considérablement entre les différentes lignées d’organismes. Cela signifie que les horloges moléculaires peuvent être inexactes lors de comparaisons entre des organismes éloignés, car l’hypothèse d’un taux d’évolution constant n’est pas valide.

En outre, l’étalonnage des horloges moléculaires constitue également un défi lorsqu’il s’agit de comparer des organismes éloignés. En effet, les archives fossiles sont souvent incomplètes et il peut être difficile de trouver des dates fiables pour la divergence des différentes lignées. En conséquence, l’étalonnage des horloges moléculaires repose souvent sur des méthodes indirectes, qui peuvent introduire une incertitude supplémentaire dans les estimations des temps de divergence.

Pour ces raisons, les horloges moléculaires ne sont pas toujours précises lorsqu’il s’agit de comparer des organismes éloignés. Cependant, ils peuvent toujours fournir des informations précieuses sur l’histoire évolutive de différentes lignées et peuvent être utilisés pour estimer les temps de divergence lorsque d’autres méthodes ne sont pas disponibles.